Plesk permette di poter cambiare il setup per dominio di apache, ma non toccando il file httpd.conf sotto la /var/www/vhosts/yourdomain.com/conf, ma aggiungendone un altro nella stessa directory che si chiama vhost.conf.
Il problema è che aggiunto il file, non basta riavviare apache ma bisogna dire a plesk, che la configurazione è cambiata digitando questo comando:
/usr/local/psa/admin/sbin/websrvmng -u --vhost-name=domain.com
oppure per tutti i domini:
/usr/local/psa/admin/bin/websrvmng -a